Vào ngày 28/01/2021, ban điều hành các Giải Bóng đá Chuyên nghiệp Quốc gia 2021 (sau đây gọi tắt là BĐH Giải) đã thông báo hoãn trận Than Quảng Ninh gặp Thành phố Hồ Chí Minh thuộc vòng 3 giai đoạn 1, được tổ chức tại SVĐ Cẩm Phả vào ngày 30/1/2021 tới vì những vấn đề liên quan đến dịch COVID-19. Đây là quyết định đã được dự báo khi phát hiện các ca bệnh mắc COVID-19 mới tại Quảng Ninh. Từ 6h00 ngày 28/1, Quảng Ninh tạm dừng toàn bộ các hoạt động vận tải khách đường bộ, đường thủy liên tỉnh, nội tỉnh (bao gồm cả phương tiện đi và đến tỉnh Quảng Ninh).[4].

Sáng ngày 29/01/2021, BĐH Giải thông báo tạm hoãn hai trận đấu: SHB Đà Nẵng – Hồng Lĩnh Hà Tĩnh vào ngày 29/01/2021 trên SVĐ Hòa Xuân, TP. Đà Nẵng và Hải Phòng – Hà Nội, ngày 30/01/2021 trên SVĐ Lạch Tray, TP. Hải Phòng[5]. Chiều cùng ngày, BĐH giải thông báo trận đấu Viettel – Becamex Bình Dương diễn ra ngày 31/01/2021 trên SVĐ Hàng Đẫy, TP. Hà Nội cũng quyết định tạm hoãn[6] (Ban đầu các trận đấu nói trên dự kiến tổ chức đằng sau những cánh cửa đóng).

Ngày 30/01/2021, BĐH Giải thông báo tạm hoãn trận đấu CLB Hoàng Anh Gia Lai – CLB Topenland Bình Định, ngày 31/01/2021 trên SVĐ Pleiku, tỉnh Gia Lai.[7]

Hai trận đấu còn lại diễn ra vào ngày 30/01/2021 (Đông Á Thanh Hóa - Nam Định trên sân Thanh Hoá và Sài Gòn - Sông Lam Nghệ An trên sân Thống Nhất) sẽ diễn ra trong điều kiện không có khán giả để đảm bảo an toàn.[8].

Sau khi kết thúc hai trận đấu vòng 3 giai đoạn 1, giải đấu sẽ tạm dừng từ để phòng chống dịch COVID-19 và nghỉ Tết Tân Sửu 2021.[9].